NH₃・NH₄（アンモニア・アンモニウムイオン）

アンモニアは水中の生物にとって非常に有害です。発生源は呼吸時に鰓から出てきたり、糞が分解されて発生するので生き物がいるので常に発生し続けます。ですので発生したアンモニアをすぐさま分解できるほどの大量のバクテリアが活躍できる場が必要になります。

性質は水に溶けてアンモニウムイオンになり、水をアルカリに傾けます。水槽内では硝化菌等により酸化されてＮＯ₂になります。このとき水中に水素イオンが増えるのでＰＨは下がります。